利用流式细胞术鉴定桦木染色体倍性和DNA含量

黄茂根, 沈凝, 刘雪羽, 吴兴盛, 陈爱平, 孟岩, 胡现铬, 童再康, 黄华宏, 楼雄珍

黄茂根, 沈凝, 刘雪羽, 等. 利用流式细胞术鉴定桦木染色体倍性和DNA含量[J]. 西南林业大学学报(自然科学), 2023, 43(1): 49–57 . DOI: 10.11929/j.swfu.202105029
引用本文: 黄茂根, 沈凝, 刘雪羽, 等. 利用流式细胞术鉴定桦木染色体倍性和DNA含量[J]. 西南林业大学学报(自然科学), 2023, 43(1): 49–57 . DOI: 10.11929/j.swfu.202105029
Huang Maogen, Shen Ning, Liu Xueyu, Wu Xingsheng, Chen Aiping, Meng Yan, Hu Xiange, Tong Zaikang, Huang Huahong, Lou Xiongzhen. Identification of Chromosomal Ploidy and DNA Content in Betula by Flow Cytometry[J]. Journal of Southwest Forestry University, 2023, 43(1): 49-57. DOI: 10.11929/j.swfu.202105029
Citation: Huang Maogen, Shen Ning, Liu Xueyu, Wu Xingsheng, Chen Aiping, Meng Yan, Hu Xiange, Tong Zaikang, Huang Huahong, Lou Xiongzhen. Identification of Chromosomal Ploidy and DNA Content in Betula by Flow Cytometry[J]. Journal of Southwest Forestry University, 2023, 43(1): 49-57. DOI: 10.11929/j.swfu.202105029

利用流式细胞术鉴定桦木染色体倍性和DNA含量

基金项目: 浙江省自然科学基金项目(LQ21C160002)资助。
详细信息
    作者简介:

    黄茂根(1972—),男,高级工程师。研究方向:苗木培育、森林经营、森林资源保护。Email: jxk8850361@163.com

    通讯作者:

    楼雄珍(1980——),女,高级实验室。研究方向:林木遗传育种。Email:13666630907@163.com

Identification of Chromosomal Ploidy and DNA Content in Betula by Flow Cytometry

  • 摘要: 基于流式细胞术(FCM)研究体系,构建能快速、准确鉴定桦木属植物倍性和测定DNA含量的研究体系,是测定不同桦木属植物倍性与基因组大小的有效方法。使用流式细胞术检测7种桦树属类物种,以物种不同生长状态(嫩叶、幼叶、成熟叶)为实验材料,不同存储方式(常温、冷藏和聚乙烯吡咯烷酮保存PVP)进行实验处理,对9种常用的裂解液进行筛选与优化。结果表明:桦木属植物DNA含量测定中,新鲜幼叶以1% PVP浸泡常温保存,并使用MgSO4裂解液制备细胞核悬浮液上机效果最佳;桦木属植物中,基因组倍性依次为黑桦((2.09 ± 0.04) Gb,8倍体) > 坚桦((1.53 ± 0.08) Gb,6倍体) > 光皮桦((0.87 ± 0.05) Gb,4倍体)=岳桦((0.80 ± 0.07) Gb,4倍体) > 垂枝桦((0.46 ± 0.03) Gb,2倍体)=河桦((0.51 ± 0.01) Gb,2倍体)。因此,桦木属植物DNA倍性和DNA含量可以通过FCM研究体系进行测定,且3倍体((0.66 ± 0.02) Gb)子代的鉴定结果表明光皮桦与河桦之间不存在生殖隔离。
    Abstract: This study aims to conduct flow cytometry(FCM) research that can accurately determine the ploidy level, DNA content, and genome size of different Betula species. Experimental materials with different growth stages(tender leaves, young leaves, mature leaves) were treated with varying methods of storage(room temperature, cold storage and polyvinylpyrrolidone, commonly referred to as PVP). Then, FCM was used to screen and optimize 9 kinds of commonly used dissociation fluids, and the cell ploidy and DNA content of the experimental materials were detected. The results showed that fresh young leaves, soaked in 1% PVP at room temperature and the nuclear suspension prepared by MgSO4 dissociation solution, is the best dissociation fluid. Of all 7 tested Betula spp., the sequence of genomic ploidy was Betula dahurica(2.09 ± 0.04 Gb, octaploid) > Betula chinensis(1.53 ± 0.08 Gb, hexaploid) > Betula luminifera(0.87 ± 0.05 Gb, tetraploid) = Betula ermanii(0.80 ± 0.07 Gb, tetraploid) > Betula pendula(0.46 ± 0.03 Gb, diploid) = Betula nigra(0.51 ± 0.01 Gb, diploid). The ploidy level of Betula luminifera × Betula nigra hybrid progeny was found to be triploid(0.66 ± 0.02 Gb), which indicated that there was no reproductive isolation between the 2 species.
  • 如何有效评估植物基因组大小是开展植物遗传改良和分子遗传学研究的关键问题之一。目前,鉴定植物基因组大小的主要方法有流式细胞术(FCM)、Feulgen光密度测定法(FDM)和全基因组测序法(WGS)[1],其中FCM操作简单、检测结果准确、检测成本低,是最常用的测定方法。例如,通过对山茶属和山茶亚属株的DNA含量进行测定,识别出普洱茶(Camellia sinensis var. assamica)的基因组大小[2];通过对蓝莓(Vaccinium spp.)个体的测定,发现其倍性丰富,包含从2倍体到6倍体等不同的种[3];通过对香蕉(Musa nana)的倍性检测,发现其至少含2倍体、3倍体和4倍体[4]。物种基因组大小的预估,可以提前预测解析其基因组所需要的成本,为后续的测序组装等分析提供重要的理论参考,同时也为遗传学和基因组学研究奠定基础。

    桦木属(Betula)的适宜生态位主要分布于北半球亚热带、温带以及寒温带地区,约有100个种[5],我国自然分布约31个种和6个变种[6],分布于我国的横断山区、四川盆地、滇南和新疆等地[7]。桦木属植物包含很多重要的用材树种,例如光皮桦(Betula luminifera)木材被我国列为一类木材,生长快、抗性强,具有很高的经济价值和广阔的开发前景。桦木属植物倍性丰富,从2倍体到12倍体不等,1C值在0.44 pg(430 Mb)到2.67 pg(2611 Mb)之间,2Cx值在371 Mb到616 Mb之间[8]。当前,桦木属植物的基因组信息还不丰富[9-10],且缺乏针对桦木属植物的基因组评估测定方法。因此,建立有效的评估体系对桦木属植物的倍性进行鉴定,可快速鉴定桦木种间杂交后代的倍性,可为未来选育出适应性强,生长速度快,材质优良的桦木新品种提供重要的技术支撑。然而,目前国内对桦木属植物的研究大部分集中在其基因功能解析,而对于桦木属植物倍性与DNA含量的研究相对较少,这也限制了我国桦木属植物的研究和快速发展。本研究利用FCM检测不同种类桦木属植物的细胞染色体的倍性,并针对不同材料、试剂先进行优选,筛选适合桦木属植物的FCM检测体系,为未来的桦木属植物的倍性育种和全基因组测序分析以及多倍体植物的形成机制探索提供研究基础和参考依据。

    7种桦树:河桦(Betula nigra)、光皮桦、光皮桦 × 河桦(Betula luminifera × Betula nigra)、垂枝桦(Betula pendula)、黑桦(Betula dahurica)、岳桦(Betula ermanii)、坚桦(Betula chinensis)均为浙江农林大学苗圃地所栽培。毛果杨(Populus trichocarpa)组培苗和光皮桦组培苗均为浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室组培室培养,其中毛果杨与垂枝桦为本实验的对照。

    流式细胞仪型号为CytoFLEX9(美国贝克曼库尔特有限公司);荧光染料为碘化丙啶(PI,SIGMA,美国);RNaseA购于天根生化科技(北京)有限公司;滤膜、鞘液等试剂均购于美国贝克曼库尔特有限公司;0.22 μm微孔滤膜购于密理博(中国)有限公司。

    实验所需细胞核裂解液的配方见表1,除Otto II常温下保存,其余裂解液均使用0.22 μm微孔滤膜进行过滤后冷藏保存。为去除双链RNA可能带来的干扰,PI染液中可以加入适量RNA酶。由于见光易分解,PI染液配制和保存方法参照弓娜等[11]制定的FCM在植物学研究中的应用方法,终浓度为50 μg/mL。

    表  1  细胞核裂解液配方
    Table  1.  Formula of nuclear dissociation fluid
    裂解液配方
    Galbraith's 30 mmol/L Na3C6H5O7 · 2H2O,45 mmol/L MgCl2,20 mmol/L MOPS,0.1% (V/V) TritonX−100(pH=7.0)
    GPB  0.5 mmol/L C10H26N4.4CIH,30 mmol/L Na3C6H5O7·2H2O,20 mmol/L MOPS,80 mmol/L KCl,20 mmol/L NaCl,0.5% (V/V) TritonX−100(pH=7.0)
    HEPES 10 mmol/L MgSO4·7H2O,50 mmol/L KCl,5 mmol/L HEPES,0.25% (V/V) TritonX−100(pH=8.0)
    LB01  15 mmol/L Tris,2 mmol/L EDTA−Na2·2H2O,0.5 mmol/L C10H26N4.4CIH,80 mmol/L KCl,20 mmol/L NaCl,15 mmol/L C2H6OS,0.1% (V/V) TritonX−100
    Marie's  50 mmol/ L C6H12O6,15 mmol/ L NaCl,15 mmol/ L KCl,5 mmol/ L EDTA−Na2,50 mmol/ LNa3C6H5O7·2H2O,0.5% (V/V) Tween−20,0.5% (V/V) C2H6OS,50 mmol/L HEPES(pH=7.2)
    MgSO4  10 mmol/L MgSO4·7H2O,50 mmol/L KCl,5 mmol/L HEPES,0.25% (V/V) TritonX−100,3 mmol/L C4H10O2S2(pH=8.0)
    mGb  45 mmol/L MgCl2,20 mmol/L MOPS,30 mmol/L Na3C6H5O7 · 2H2O,1% (V/V) PVP−40,0.2% (V/V) TritonX−100,10 mmol/L EDTA−Na2·2H2O,20 mmol/L C2H6OS(pH=8.0)
    OTTO  Otto I:100 mmol/L C5H6O7,0.5% (V/V) Tween−20(pH=2.0~3.0);Otto II:400 mmol/L Na2HPO4·12H2O(pH=8.0~9.0)(细胞核在Otto I buffer中提取,DNA染色在Otto I和Otto II的混合液(1∶4)中进行。)
    Tris−MgCl2 200 mmol/L Tris,4 mmol/L MgCl2·6H2O,0.5% (V/V) TritonX−100(pH=7.0~8.0)
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    选取60 mg植物新鲜叶片放入9 cm的一次性培养皿中,加入1 mL预冷的细胞裂解液与500 μL浓度为1% PVP溶液,用锋利的双面刀片快速切碎。利用3 mL塑料吸管将悬浮液吸取并通过500目的滤膜将悬浮液过滤,滤液收集至2 mL离心管中,冰上静置5 min。1000 r/min离心5 min,弃上清,加入100 μL预冷的裂解液重悬,再加入150 μL预冷的含RNase的PI染液对细胞核进行荧光染色,4 ℃避光孵育5 min。用500目的滤膜再过滤,移至上样管,上机检测,低速收集记录10000个颗粒。

    叶片状态分为3种:嫩叶为2个月的组培苗从上往下数第1或2片叶片,幼叶为野外1 a生枝条从上往下数的第1至2片叶,成熟叶为野外1 a生枝条上第5片叶片。

    当天采集幼叶的保存方式分为4种:保存方式1,将其放入保鲜袋中常温保存;保存方式2,将其放入保鲜袋中冷藏保存;保存方式3,放入含有1% PVP的PE管中常温保存(3 h);保存方式4,放入含有1% PVP的PE管中常温保存24 h。

    对已知DNA含量的对照样本进行测定,根据通过PI染色的细胞核的相对荧光强度比值来计算出待测样本的DNA含量[12],再通过已知倍性为2倍体的垂枝桦的荧光强度来计算出未知桦木属植物的DNA倍性。

    PI荧光激发波长为488 nm,上机后收集通道585/42BP的荧光,检测PI发射的荧光强度。变异系数(CV)值控制在5%以内。使用CyExpert软件进行数据收集与分析。参照Huang等[2]提供的计算公式计算样本的1C值。每个样本检测3次,利用SPSS 22软件进行数据的显著性分析。

    由于目前植物还没有通用的细胞核裂解液,因此筛选出对该物种细胞核提取效果最佳的裂解液对于流式细胞检测而言至关重要。本实验利用光皮桦组培苗嫩叶为材料进行实验,结果如图1所示,Galbraith's、GPB、LB01、Marie's裂解液杂质多,均出现明显杂质峰,其中Marie's裂解液收集的有效细胞核数最少(不足160),通过散点图发现颗粒分布并不集中,大部分为细胞杂质碎片,表明这些裂解液不能较好的提取细胞核。图1c、i中发现HEPES与Tris−MgCl2裂解液所得直方图虽看起来杂质干扰较少,但HEPES裂解液的CV值大于5%,结果不可信,Tris−MgCl2裂解液所得直方图出现G1 + G2期峰,说明出现了细胞核黏连的情况。图1h发现OTTO裂解液显示G1期峰左右不对称,对光皮桦而言不是最佳裂解液。图1f、g中mGb裂解液与MgSO4裂解液所得G1期峰左右对称,G2期峰明显,无杂峰干扰,mGb裂解液提取速率为311个/秒,MgSO4裂解液提取速率为485 个/秒,提取速率高,均可作为制备光皮桦组培苗单细胞悬浮液的裂解液。但MgSO4裂解液提取效果略高,因此,选择MgSO4裂解液进行进一步实验。

    图  1  光皮桦样品不同裂解液流式细胞分析直方图
    Figure  1.  Histograms of Betula prepared from different nuclear dissociation solutions

    图2c可知,由于成熟叶次生代谢旺盛,产生大量多糖多酚物质易被氧化,使提取液变得浓稠,无法通过500目的滤膜,从而干扰MgSO4裂解液的提取效率,使得收集有效颗粒数极少,不到20个,G1期峰出峰困难,杂峰明显。图2b中幼叶G1期出峰明显,G2期清晰,收集有效细胞核数比嫩叶稍低,结果清晰可靠。虽然嫩叶的直方图最好,但由于外植体杀菌进行组培培养时间长,培养程序复杂,而幼叶来源简单,采摘方便,更适合野外样品的快速检测,可替代嫩叶制备细胞核悬浮液进行流式检测。

    图  2  MgSO4裂解液制备嫩叶、幼叶与成熟叶
    Figure  2.  The preparation of tender, young and old leaves with MgSO4 buffer

    图3a可知,常温保存的G1期峰明显,杂峰干扰较大。由于常温保存会使叶片中多糖多酚类物质氧化干扰裂解液提取细胞核而产生较大的杂质峰,CV值为5.00%。图3b为冷藏保存, G1和G2期峰明显,杂峰较少,CV值小于5.00%,这种保存方式较好,但野外采样携带冰盒不便。由图3c可知,叶片放入1%PVP 液体中也可以减少叶片中多糖多酚物质氧化,从而使细胞核悬浮液检测所得直方图杂质峰较小,G1期峰左右对称,G2期峰明显,能得到冷藏保存的检测效果,且细胞核提取量较高。由图3d可知,保存时间对提取效果影响巨大,G1期峰左边出现明显杂质峰,CV值为6.84%,大于5%,一般情况下CV值在5%以下为可信,所以结果不可靠。野外采样为了减少负重,增加样品量将待测幼叶放入1%PVP中浸泡常温保存并及时上机检测比较好。

    图  3  不同保存方式对检测效果的影响
    Figure  3.  The effect of different preservation methods on detection effect

    利用光皮桦筛选所得的流式细胞术体系检测对其余桦木属植物的适用性。由于对照样本杨树(Populus sp.)与垂枝桦的基因组大小相近,所以采用外标法进行检测。用已知基因组大小的毛果杨作为对照,检测已知倍性和基因组大小的2倍体桦木垂枝桦,初步确定对照与待测样本的荧光强度范围,设定检测模板,在同一个模板下对其余6个桦木属植物进行倍性鉴定。PI染液可以非特异性结合碱基,适用于基因组大小测定与倍性鉴定,为防止RNA干扰加入RNaseA,此时的荧光强度可以代表DNA相对含量[13]。因此,根据DNA含量计算公式[1]可算出待测样品DNA含量。以毛果杨为参照估测其余桦木属植物DNA含量,并以垂枝桦为对照估测其余桦木属植物DNA倍性。结合图4表2发现河桦与垂枝桦的DNA倍性均为2倍体,光皮桦 × 河桦DNA倍性为3倍体,光皮桦与岳桦的DNA倍性为4倍体,坚桦DNA倍性为6倍体,黑桦DNA倍性为8倍体。光皮桦基因组为 (889.29 ± 48.94) Mb,河桦基因组大小为 (519.78 ± 12.18) Mb,光皮桦 × 河桦的DNA含量在河桦与光皮桦之间,为 (670.66 ± 21.81) Mb,估计为3倍体,由此可证明光皮桦与河桦之间无生殖隔离,这可为未来的倍性育种提供新的依据。

    图  4  桦木属植物DNA峰值图
    Figure  4.  Flow histogram of Betula
    表  2  桦木属DNA含量及倍性估计
    Table  2.  Ploidy and DNA content in Betula
    样本 峰值 DNA含量/ (Mb·C−1)DNA倍性 1Cx值/pg
    垂枝桦165895.40 ± 12191.11471.94 ± 34.68a0.48 ± 0.01a
    河桦182713.80 ± 4281.82519.78 ± 12.18a0.53 ± 0.02b
    光皮桦 × 河桦235750.63 ± 7668.16670.66 ± 21.81b0.46 ± 0.04a
    岳桦289028.37 ± 24180.25822.22 ± 68.79c0.42 ± 0.03a
    光皮桦312605.46 ± 17203.91889.29 ± 48.94c0.45 ± 0.03a
    坚桦549673.80 ± 30055.001563.70 ± 85.50d0.53 ± 0.05ac
    黑桦752243.27 ± 14608.202139.96 ± 41.56e0.55 ± 0.06bc
     注:1 pg=978 Mb;不同小写字母表示差异显著(P<0.05)。
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    分析结果显示,垂枝桦基因组大小为 (471.94 ± 34.68) Mb,这与Saloj等[14]发表的垂枝桦基因组大小(440 Mb)非常相近。此外,岳桦、坚桦、黑桦的基因组大小分别为 (822.22 ± 68.79) Mb、 (1563.70 ± 85.50) Mb、(2139.96 ± 41.56) Mb。同时,不同倍性桦木的DNA含量差异显著(P<0.05),相同倍性桦木的DNA含量差异不显著(表2),由此可以推测桦木属植物多倍体可能是由染色体加倍导致,基因组缩小现象也不明显。为进一步研究桦木基因组大小演变,本研究还计算了1Cx值,其中方差分析发现1Cx为0.42~0.55 pg,基本分为垂枝桦与河桦两大类,黑桦单独为一类,垂枝桦与光皮桦 × 河桦、岳桦、光皮桦、坚桦的1Cx值差异均不显著,与河桦、黑桦间1Cx值差异显著 (P<0.05);河桦与黑桦之间1Cx值差异不显著;坚桦与黑桦之间1Cx值差异不显著,黑桦与其余桦木1Cx值差异均显著 (P<0.05)。

    FCM检测具有速度快、重复性好、检测准确等优点,但准确度受植物组织、裂解液、叶片的成熟度和保存方式的影响较大。其中裂解液是FCM检测倍性实验成功的关键,它决定了细胞核能否完整的被分离出来,细胞核能否被PI染料染色。目前,还未发现植物的通用裂解液,因此需要筛选甚至优化裂解液来获得最佳的细胞核悬浮液进行上机检测。判断本实验结果可靠性的标准是CV值[12],CV值越小,所得峰值结果越可靠,一般来说CV值小于5%可视为可信。本实验对9种裂解液进行筛选,最终得出MgSO4裂解液提取效果最佳,CV值控制在3%以内。FCM方法鉴定倍性的实验中,不同物种对应的最优裂解液也不同,如对槭属植物解离效果均较好的是LB01解离液[15];Galbraith's解离液对莲瓣兰(Cymbidium tortisepalum)和墨兰(Cymbidium sinense)样品解离效果最好[16];同时,研究发现使用Galbraith's解离液对金线莲(Anoectochilus roxburghii)样品的解离效果也较好[17]。桦木属植物叶片含有丰富的多糖与多酚物质,易被氧化,提取时加入500 μL体积浓度为1%PVP和裂解液中的TritonX−100可消除糖类、酚类杂质带来的影响[18],MgSO4裂解液含有稳定核染色体的Mg2+,KCl可以维持植物细胞渗透压,使细胞不易破碎,减少胞质中的多糖与多酚物质游离出来影响细胞核悬浮液的质量,DTT的加入使染色质得到保护,进一步消除酚类物质对DNA染色的影响[11]。选择合适的材料与保存方式可提高FCM的可行性,通常新鲜幼叶更加容易被检测。叶片的生长状态直接影响到制备的细胞核悬浮液能否用于检测,一般情况下,老叶中的酚类次生代谢产物较多,易被氧化从而破坏细胞核的结构[19],例如栎属植物老叶的细胞核提取产率就远低于幼叶[20]。本研究得出桦木属植物新鲜幼叶在1% PVP溶液中浸泡常温保存,用MgSO4裂解液制备细胞悬浮液进行检测效果较好。

    桦木属植物的材质优良,经济价值高[7],部分种可作为观赏树种,且种间与种内变异丰富,是优良的林木遗传研究材料。然而,桦木属植物的基因组信息还不丰富[9-10],目前在植物DNA C值数据库中仅包含5个桦木树种[16]。“1C值”的概念由Greilhuber 等[21]于2005年提出,代表一半体细胞DNA的含量(2C),是统计植物基因组大小的有效指标。本研究发现不同倍性桦木DNA含量存在显著差异,1C值在0.42~0.55 pg之间,与Wang等[8]发现桦木属植物从2倍体到12倍体的1C值在0.42~0.57 pg之间结果相似。此外,本研究结果中发现垂枝桦与光皮桦倍性不同,但它们之间1Cx值差异不显著,且坚桦与黑桦也属于类似情况,这可能是由于植物体内多倍化水平由组织器官和发育阶段差异造成。植物不同器官的多倍化水平不一致现象已经在芸薹属[22]、紫薇(Lagerstroemia indica[23],大麦(Hordeum vulgare)和小麦(Triticum aestivum[24]等植物中被发现,但桦木属植物中还缺乏类似的研究,未来需要更深入的研究。此外,基因组重复或加倍、DNA丢失等均是造成基因组C值差异的重要因素[19],目前国内关于桦木属植物C值的测定还未展开,还需要更多的研究来分析桦木属植物的基因组变化规律和主要影响因素。

    对桦木植物倍性的鉴定中,本实验所测得河桦为2倍体,但河桦种内变异相对较大,种内存在2倍体、3倍体和4倍体等不同倍性变种[25]。本实验中垂枝桦基因组大小被鉴定为0.48 pg,这与Saloj 等[18]所测基因组0.45 pg大小相近。光皮桦 × 河桦杂种的倍性为3倍体,由此可知2倍体河桦与4倍体光皮桦间不存在生殖隔离,能通过杂交产生新的桦木种质。大部分情况下,3倍体植物一般不育,生殖生长所需营养可供给营养生长,使木材的材性更加优良,因此,3倍体林木的繁育更有利于材质的改良。FCM鉴定出光皮桦 × 河桦子代倍性为3倍体,可以为种间杂种鉴定提供一条新的研究道路。此外,FCM在其他桦木树种上也有成功的应用,如冰岛的沼桦(Betula nana)被鉴定为2倍体,西伯利亚银色桦(B. pubescens)为4倍体,沼桦 × 西伯利亚银色桦(B. nana × B. pubescens)为3倍体,平均1C值分别为448、666、882 Mb [26],与本研究中的河桦、光皮桦、光皮桦 × 河桦所测结果相似,说明FCM是鉴定桦木倍性的有效手段,且自然界广泛存在着不同倍性桦木杂交以适应新的环境。相对于传统的染色体计数法来确定植物的倍性,FCM的研究方法相对简单,工作量较小,对实验室的条件要求也不高,但显微镜以及更先进的扫描电镜对植物染色体进行观察仍然是确定植物倍性最基本的方法,往往多种方法的结合运用才能更精确的鉴定植物倍性。

    本研究发现,MgSO4裂解液是提取光皮桦细胞核的最佳裂解液,桦木属植物幼叶次生代谢产物少,适合作为FCM的检测材料。研究结果分别揭示了垂枝桦、河桦、光皮桦 × 河桦、岳桦、光皮桦、坚桦、黑桦的DNA倍性和含量,为桦木属植物的基因组学研究、细胞生物学和种质资源研究提供了基础数据。同时,有效的FCM评估体系的建立,可快速鉴定桦木种间杂交后代的倍性,可为未来选育出适应性强,生长速度快,材质优良的桦木新品种提供重要的技术支撑。

  • 图  1   光皮桦样品不同裂解液流式细胞分析直方图

    Figure  1.   Histograms of Betula prepared from different nuclear dissociation solutions

    图  2   MgSO4裂解液制备嫩叶、幼叶与成熟叶

    Figure  2.   The preparation of tender, young and old leaves with MgSO4 buffer

    图  3   不同保存方式对检测效果的影响

    Figure  3.   The effect of different preservation methods on detection effect

    图  4   桦木属植物DNA峰值图

    Figure  4.   Flow histogram of Betula

    表  1   细胞核裂解液配方

    Table  1   Formula of nuclear dissociation fluid

    裂解液配方
    Galbraith's 30 mmol/L Na3C6H5O7 · 2H2O,45 mmol/L MgCl2,20 mmol/L MOPS,0.1% (V/V) TritonX−100(pH=7.0)
    GPB  0.5 mmol/L C10H26N4.4CIH,30 mmol/L Na3C6H5O7·2H2O,20 mmol/L MOPS,80 mmol/L KCl,20 mmol/L NaCl,0.5% (V/V) TritonX−100(pH=7.0)
    HEPES 10 mmol/L MgSO4·7H2O,50 mmol/L KCl,5 mmol/L HEPES,0.25% (V/V) TritonX−100(pH=8.0)
    LB01  15 mmol/L Tris,2 mmol/L EDTA−Na2·2H2O,0.5 mmol/L C10H26N4.4CIH,80 mmol/L KCl,20 mmol/L NaCl,15 mmol/L C2H6OS,0.1% (V/V) TritonX−100
    Marie's  50 mmol/ L C6H12O6,15 mmol/ L NaCl,15 mmol/ L KCl,5 mmol/ L EDTA−Na2,50 mmol/ LNa3C6H5O7·2H2O,0.5% (V/V) Tween−20,0.5% (V/V) C2H6OS,50 mmol/L HEPES(pH=7.2)
    MgSO4  10 mmol/L MgSO4·7H2O,50 mmol/L KCl,5 mmol/L HEPES,0.25% (V/V) TritonX−100,3 mmol/L C4H10O2S2(pH=8.0)
    mGb  45 mmol/L MgCl2,20 mmol/L MOPS,30 mmol/L Na3C6H5O7 · 2H2O,1% (V/V) PVP−40,0.2% (V/V) TritonX−100,10 mmol/L EDTA−Na2·2H2O,20 mmol/L C2H6OS(pH=8.0)
    OTTO  Otto I:100 mmol/L C5H6O7,0.5% (V/V) Tween−20(pH=2.0~3.0);Otto II:400 mmol/L Na2HPO4·12H2O(pH=8.0~9.0)(细胞核在Otto I buffer中提取,DNA染色在Otto I和Otto II的混合液(1∶4)中进行。)
    Tris−MgCl2 200 mmol/L Tris,4 mmol/L MgCl2·6H2O,0.5% (V/V) TritonX−100(pH=7.0~8.0)
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    表  2   桦木属DNA含量及倍性估计

    Table  2   Ploidy and DNA content in Betula

    样本 峰值 DNA含量/ (Mb·C−1)DNA倍性 1Cx值/pg
    垂枝桦165895.40 ± 12191.11471.94 ± 34.68a0.48 ± 0.01a
    河桦182713.80 ± 4281.82519.78 ± 12.18a0.53 ± 0.02b
    光皮桦 × 河桦235750.63 ± 7668.16670.66 ± 21.81b0.46 ± 0.04a
    岳桦289028.37 ± 24180.25822.22 ± 68.79c0.42 ± 0.03a
    光皮桦312605.46 ± 17203.91889.29 ± 48.94c0.45 ± 0.03a
    坚桦549673.80 ± 30055.001563.70 ± 85.50d0.53 ± 0.05ac
    黑桦752243.27 ± 14608.202139.96 ± 41.56e0.55 ± 0.06bc
     注:1 pg=978 Mb;不同小写字母表示差异显著(P<0.05)。
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出版历程
  • 收稿日期:  2021-05-18
  • 修回日期:  2021-08-28
  • 网络出版日期:  2022-10-24
  • 发布日期:  2023-01-19

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